1、需要培訓專門的技術人員。人工授精是一項相對操作較複雜的工作，需要有專門的、熟練的技術人員才能達到滿意的效果，如果由於某一環節的疏忽，會對豬場的效益造成很大的影響。2、豬人工授精，長期保存稀釋精液有一定的難度。現在豬常溫保存精液大概在7天左右，現在的冷凍保存技術還需要進一步研究才能在生產中應用。3、增加實驗室和試劑成本，必須具備常用的設備如顯微鏡、消毒設施等。

4、如果使用感染了疾病公豬的精液，疾病傳播的速度要比自然交配方式快得多。

5、如果養豬場本身的生產水平不高，技術不達標，使用人工授精可能導致子宮內膜炎增加，受孕率低，母豬產仔數小。建議先學技術，後進行小規模人工授精試驗，或自然交配與人工授精結合，隨著生產水平和技術的不斷提高，再進行推廣。