黑藻的雄花呈綠 {MOD}，接近球形，它的胸花多生長在苞片內，在開花時花朵會伸出水麵，它的雌花成熟後會從佛焰苞內長出。黑藻在開花時也會結果，它的果實爲圓柱形，果實外長有很多刺狀凸起的東西，摸起來很紮手。