龍眼的病蟲害高達50種，但是對龍眼生長、產量和質量產生的影響並不是比較嚴重。龍眼最主要的病蟲害爲鬼帚病，係病毒感染所造成的。得病之後導致枝幹畸形，葉子窄小，打卷不展，常成禿枝散生狀，病花穗散生成短簇狀而無法正常的開花牢固。